Bonjour,
Une copie d'écran (sauf si problème de confidentialité) permettrait de donner une réponse plus précise.
Si vous créez le père d'une personne et pas la mère, vous aurez la case du père et une case vide de couleur blanche. C'est normal, une personne a forcément un père et une mère, Cette case blanche n'est pas une fiche vide, ce n'est même pas une fiche (rien n'est enregistré dans la base), c'est juste un affichage.
Pour les parents non visibles, c'est un autre problème, il faudrait en dire plus sur la façon dont vous avez créé les liens.
Quelle version de Généatique avez-vous ?