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Il est possible que cette inversion soit liée à votre export Gedcom, regardez s'il n'y a pas une option qui permette d'inverser l'ordre des Noms et Prenoms lors de l'export, cela vous évitera de devoir faire manuellement les modifications à l'avenir.
Une solution alternative consiste à passer par Généatique pour générer un export Gedcom adapté à mes-arbres.net.