Vous ne devez pas confondre "fiches personnes en double dans la base de données" et "personnes apparaissant deux fois dans l'arbre affiché".
Si vous avez un mariage entre cousins (implexe), ils ont donc des ancêtres communs qui peuvent apparaitre deux fois dans l'arbre, mais n'existent qu'une fois dans la BD.
L'option "gérer les implexes" doit être activée dans le paramétrage de l'arbre afin d'éviter cet affichage en double.