Il me semble que l'on en a déjà parlé ; avez vous essayé de modifier l'ordre des fichiers images avec l'explorateur de fichiers avant de faire la compile pdf ? Vous pouvez même les mettre dans un ordre quelconque en les déplaçant avec la souris. Évidemment il faut qu'il y ait déjà un minimum d'ordre si vous avez 2000 images dans un répertoire ; généralement c'est un nom des personnes qui est en premier dans le nom du fichier et qui donne un premier classement.
Pour un utilitaire pdf qui ferait un classement, je ne sais pas, mais faites une recherche web, il y a pas mal de freewares sur les pdf.